明場顯微鏡

顯微鏡的類型通常用于生物顯微鏡。它用直射光照射整個樣品，并用透射或反射光觀察它。這種顯微鏡具有明亮的背景，并廣泛用于檢查染色的樣品，病理和半導體。

暗場顯微鏡

這種顯微鏡只能使樣品散射或衍射的光進入透鏡，從而可以將光投射到暗視場上。它適用于觀察無色透明樣品，例如活細胞，這些樣品很難通過明場顯微鏡鑒定。暗場顯微鏡還可以觀察超出光學顯微鏡分辨率極限的微小特征。這種類型的顯微鏡使用特殊的聚光鏡。

相襯顯微鏡

這種顯微鏡基于光衍射引起的相襯（光變化）。無色透明樣品（例如活組織和細胞）難以使用明場成像，但由于折射率或厚度不同，它們會產生相襯。將這種對比度轉換為亮度對比度可以觀察到這種類型的樣品。
這種顯微鏡使只能在暗視野下觀察到的細胞和其他物體可以在亮視野下觀察到。另外，可以看到活體標本，因為它們不需要染色。這種觀察方法需要使用帶有狹縫的環狀相位板。

偏光顯微鏡

這種類型的顯微鏡使用偏振（光的振動方向偏置）照射樣品，并利用兩個可旋轉的偏振板進行觀察。如果板平行，則樣品看起來很亮；如果板垂直，則樣品看起來很暗。
這種顯微鏡對于觀察巖石和礦物切片以確定其晶體結構很有用。它還可用于觀察纖維，聚合物，半導體和骨組織。
觀察時使用特殊的物鏡和兩種類型的偏光板：起偏鏡和檢偏鏡。

微分干涉對比顯微鏡

與相襯顯微鏡一樣，微分干涉對比（DIC）顯微鏡也適合觀察無色透明樣品。在成像技術方面有所不同，因為DIC將光傳播方式的差異轉換為亮度變化，而相襯使用光衍射。
它適用于觀察相對較厚的樣本，還可以進行3D成像。另外，由于用這種顯微鏡拍攝的圖像與用相差顯微鏡拍攝的圖像互補，因此通過比較兩者的結果，可以進行更準確的觀察。
如果物鏡適合這種顯微鏡，則標記為“ DIC”。

調制對比顯微鏡

調制對比顯微鏡也稱為浮雕對比顯微鏡，適用于觀察無色透明樣品。調制對比度將樣品表面高度的差異轉換為亮度對比度以進行觀察。
與差分干涉對比一樣，盡管原理不同，但仍可以3D模式觀察圖像。另一個區別是調制對比度顯微鏡允許使用塑料容器，而差分干涉對比度則不允許。因此，該顯微鏡適于觀察精子和卵細胞。

反射光顯微鏡

這種顯微鏡使用反射光觀察不透光的樣品，例如巖石和礦物。此類別還可以進一步分為子場，例如明場，暗場和差分干擾。

分散染色顯微鏡

通過將樣品浸入索引油中，色散染色顯微鏡通過檢測不同折射率油的光色散來進行觀察。它主要用于識別石棉及其類型。